Ahli pulmonologi terlibat dalam kedua-dua penyelidikan klinikal dan asas sistem pernafasan, mulai dari anatomi epitel pernafasan ke rawatan hipertensi pulmonari yang paling berkesan. Penyelidikan saintifik juga berlaku untuk mencari penyebab dan kemungkinan rawatan penyakit seperti tuberkulosis pulmonari dan kanser paru-paru.